Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNTG1Q9NSN8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms