Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)30.61■■■□□ 2.493e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.143e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 525.57■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 521.6■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 GRIPAP1-210ENST00000617369 531 ntTSL 319.82■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 ALG13-221ENST00000490774 325 ntTSL 24.47□□□□□ -1.693e-8■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CCHCR1-228ENST00000509552 2304 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 DDB1-214ENST00000539426 805 ntTSL 313.11□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 SND1-202ENST00000461056 555 ntTSL 49.87□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 RNPEP-208ENST00000479531 667 ntTSL 212.19□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)27.94■■■□□ 2.063e-8■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.19e-8■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-8■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 SGSM2-213ENST00000574857 3885 ntTSL 217.02■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 TELO2-202ENST00000497339 1667 ntTSL 524.91■■□□□ 1.585e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 DNAJC11-209ENST00000472414 725 ntTSL 317.14■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 225.04■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 POLRMT-203ENST00000589961 490 ntTSL 322.28■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 27.1
DDX24Q9GZR7 AAAS-207ENST00000547520 769 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.42e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.126e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-229ENST00000514234 2562 ntTSL 221.8■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 521.65■■□□□ 1.066e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.826e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-220ENST00000506488 2997 ntTSL 519.53■□□□□ 0.726e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.66e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 218.67■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 218.09■□□□□ 0.496e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 217.81■□□□□ 0.446e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.332e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.439e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.8□□□□□ -0.29e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.399e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 HERC2-209ENST00000567869 3523 ntTSL 29.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.687e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.57e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.267e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.897e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.137e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 NUP188-202ENST00000464729 408 ntTSL 26.74□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.932e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 522.66■■□□□ 1.222e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 FANCA-212ENST00000563513 571 ntTSL 422.65■■□□□ 1.222e-14■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-228ENST00000552879 568 ntTSL 414.36□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 PAN2-208ENST00000547994 2605 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MAN2A2-209ENST00000558640 532 ntTSL 319.02■□□□□ 0.646e-22■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 YEATS2-205ENST00000481343 464 ntTSL 413.57□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 LMBR1L-218ENST00000551143 578 ntTSL 315.21■□□□□ 0.035e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 DNMT1-215ENST00000588913 1775 ntTSL 521.13■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 DNMT1-212ENST00000587197 809 ntTSL 220.92■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 INTS11-214ENST00000470030 2369 ntTSL 517.11■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 INTS11-212ENST00000462432 2863 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 PDE8A-212ENST00000560333 543 ntTSL 312.07□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 TNRC6A-213ENST00000568750 609 ntTSL 512.46□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 225.13■■□□□ 1.617e-9■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.517e-9■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 GGT7-203ENST00000469018 1064 ntTSL 517.55■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 AGRN-208ENST00000479707 584 ntTSL 322.85■■□□□ 1.252e-15■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 SLC12A4-212ENST00000573023 3649 ntTSL 522.07■■□□□ 1.128e-7■■■■■ 27
DDX24Q9GZR7 MYO18A-220ENST00000588791 650 ntTSL 519.29■□□□□ 0.683e-7■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RHOT2-225ENST00000570092 674 ntTSL 330.13■■■□□ 2.412e-11■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RHOT2-207ENST00000562708 672 ntTSL 527.66■■■□□ 2.022e-11■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 537.66■■■■□ 3.626e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.146e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RAB26-204ENST00000562735 1720 ntTSL 532.17■■■□□ 2.743e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.713e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 KIFC3-209ENST00000562311 777 ntTSL 530.52■■■□□ 2.483e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.316e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 KIFC3-223ENST00000565684 623 ntTSL 527.38■■□□□ 1.973e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 226.99■■□□□ 1.912e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 ACAD9-202ENST00000505192 1693 ntTSL 226.58■■□□□ 1.854e-12■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 MCM2-203ENST00000468659 557 ntTSL 425.68■■□□□ 1.76e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RNF8-201ENST00000229866 2124 ntTSL 225.44■■□□□ 1.662e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 FBXW5-207ENST00000487794 1932 ntTSL 1 (best)24.98■■□□□ 1.592e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.566e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 TTC31-207ENST00000459957 873 ntTSL 224.76■■□□□ 1.556e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.482e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RAB26-203ENST00000561600 699 ntTSL 224.05■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 DENND6B-205ENST00000495607 2450 ntTSL 223.84■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RAB26-205ENST00000564426 1922 ntTSL 1 (best)23.51■■□□□ 1.353e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 RAB26-208ENST00000567145 609 ntTSL 523.26■■□□□ 1.313e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 MCM2-207ENST00000477668 2510 ntTSL 222.68■■□□□ 1.226e-6■■■■■ 26.9
DDX24Q9GZR7 FAM193B-216ENST00000513502 705 ntTSL 222.35■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 26.9
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