Protein–RNA interactions for Protein: Q6UDR6

SPINT4, Kunitz-type protease inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT4Q6UDR6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
SPINT4Q6UDR6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SPINT4Q6UDR6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms