Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF58

IFFO2, Intermediate filament family orphan 2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO2Q5TF58 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFFO2Q5TF58 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFFO2Q5TF58 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms