Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRJQ12913 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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PTPRJQ12913 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPRJQ12913 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
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