Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RPS2-206ENST00000527302 719 ntTSL 327.58■■■□□ 2.014e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-205ENST00000527109 1030 ntTSL 1 (best)27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-207ENST00000527826 837 ntTSL 1 (best)27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.924e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.884e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-215ENST00000533872 1114 ntTSL 526.26■■□□□ 1.794e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-208ENST00000527871 1243 ntTSL 1 (best)25.73■■□□□ 1.714e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-213ENST00000533161 1186 ntTSL 1 (best)25.11■■□□□ 1.614e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 RPS2-217ENST00000563194 170 ntTSL 54.14□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 PDLIM7-211ENST00000504318 597 ntTSL 314.84□□□□□ -0.038e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 CNOT3-208ENST00000613073 2778 ntTSL 217.77■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 NCLN-204ENST00000588428 1080 ntTSL 522.24■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 46.3
UTP3Q9NQZ2 DKC1-202ENST00000412124 670 ntTSL 57.68□□□□□ -1.188e-10■■■■■ 46.2
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.948e-10■■■■■ 46.2
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -18e-10■■■■■ 46.2
UTP3Q9NQZ2 TECR-214ENST00000598715 541 ntTSL 510.99□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 46.2
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 46.2
UTP3Q9NQZ2 CROCC-211ENST00000494191 1996 ntTSL 523.58■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 CROCC-213ENST00000498688 583 ntTSL 322.24■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 CROCC-209ENST00000486318 724 ntTSL 521.66■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 11e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 CROCC-207ENST00000467938 2515 ntTSL 220.04■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-202ENST00000367869 623 ntTSL 319.48■□□□□ 0.711e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.71e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.581e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-205ENST00000457715 865 ntTSL 518.23■□□□□ 0.511e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 CROCC-202ENST00000445545 3931 ntTSL 517.24■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-204ENST00000416965 991 ntTSL 315.84■□□□□ 0.131e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TRIM11-205ENST00000602308 586 ntTSL 315.14■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.141e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 DIP2A-208ENST00000478105 3234 ntTSL 212.81□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 411.94□□□□□ -0.51e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.631e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.061e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 FOCAD-215ENST00000605031 556 ntTSL 48.18□□□□□ -1.11e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 FOCAD-212ENST00000604103 591 ntTSL 47.5□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 55.86□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-201ENST00000344102 2690 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-238ENST00000557135 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 WARS-204ENST00000392882 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.913e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 46.1
UTP3Q9NQZ2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 TFR2-209ENST00000473963 771 ntTSL 315.46■□□□□ 0.073e-10■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-227ENST00000602564 3695 ntTSL 516.46■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-210ENST00000581332 451 ntTSL 422.6■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 ENOSF1-208ENST00000580605 699 ntTSL 313.84□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 GSE1-206ENST00000438180 1741 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 GSE1-207ENST00000469381 5885 ntTSL 213.75□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-205ENST00000435022 616 ntTSL 523.66■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-203ENST00000416526 711 ntTSL 323.36■■□□□ 1.338e-7■■■■■ 46
UTP3Q9NQZ2 SNRPA1-205ENST00000558036 2108 ntTSL 222.18■■□□□ 1.143e-8■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 SNRPA1-203ENST00000540017 506 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.733e-8■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 SNRPA1-202ENST00000394082 556 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 SNRPA1-207ENST00000559309 924 ntTSL 515.82■□□□□ 0.123e-8■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.112e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 218.77■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LASP1-207ENST00000581485 617 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-10■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LASP1-202ENST00000419929 762 ntTSL 316.62■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.252e-10■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LASP1-208ENST00000584106 1167 ntTSL 214.07□□□□□ -0.162e-10■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-208ENST00000504788 1801 ntTSL 25.29□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 226.98■■□□□ 1.917e-9■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 325.65■■□□□ 1.77e-9■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 RBM12-206ENST00000435161 565 ntTSL 412.91□□□□□ -0.347e-9■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 RBM12-205ENST00000431148 583 ntTSL 412.3□□□□□ -0.447e-9■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 MICALL2-211ENST00000487156 874 ntTSL 520.39■□□□□ 0.855e-16■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 217.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 313.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 LTBP4-202ENST00000243562 3140 ntTSL 215.35■□□□□ 0.058e-7■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 45.9
UTP3Q9NQZ2 CLPTM1L-207ENST00000506641 792 ntTSL 517.92■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 SDHA-205ENST00000504824 1430 ntTSL 518.37■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.499e-11■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 LASP1-204ENST00000435347 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.59e-11■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.559e-11■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 POLR2D-204ENST00000487079 1037 ntTSL 226.28■■□□□ 1.83e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 POLR2D-201ENST00000272645 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 POLR2D-203ENST00000409955 1758 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-205ENST00000593136 500 ntTSL 514.29□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 GALNT5-203ENST00000463418 667 ntTSL 29.92□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 219.66■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 45.8
UTP3Q9NQZ2 CREBZF-203ENST00000525639 2850 ntTSL 519.65■□□□□ 0.743e-6■■■■■ 45.8
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