RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445545.6

CROCC-202, Transcript of ciliary rootlet coiled-coil, rootletin, humanhuman

TSL 5

Gene CROCC, Length 3,931 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC-202ENST00000445545 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.57■■■□□ 2.48
CROCC-202ENST00000445545 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.14■■■□□ 2.25
CROCC-202ENST00000445545 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.72■■■□□ 2.03
CROCC-202ENST00000445545 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
CROCC-202ENST00000445545 ABCC9O60706 1549 aa26.57■■□□□ 1.84
CROCC-202ENST00000445545 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.02■■□□□ 1.76
CROCC-202ENST00000445545 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
CROCC-202ENST00000445545 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CROCC-202ENST00000445545 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.47■■□□□ 1.67
CROCC-202ENST00000445545 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CROCC-202ENST00000445545 SCRIBQ14160 1630 aa25.17■■□□□ 1.62
CROCC-202ENST00000445545 TRIM41Q8WV44 630 aa25.04■■□□□ 1.6
CROCC-202ENST00000445545 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CROCC-202ENST00000445545 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CROCC-202ENST00000445545 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.69■■□□□ 1.54
CROCC-202ENST00000445545 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.61■■□□□ 1.53
CROCC-202ENST00000445545 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.59■■□□□ 1.53
CROCC-202ENST00000445545 NACADO15069 1562 aa24.48■■□□□ 1.51
CROCC-202ENST00000445545 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CROCC-202ENST00000445545 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CROCC-202ENST00000445545 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.36■■□□□ 1.49
CROCC-202ENST00000445545 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
CROCC-202ENST00000445545 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.22■■□□□ 1.47
CROCC-202ENST00000445545 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CROCC-202ENST00000445545 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.13■■□□□ 1.45
CROCC-202ENST00000445545 APLP2Q06481 763 aa24.13■■□□□ 1.45
CROCC-202ENST00000445545 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.91■■□□□ 1.42
CROCC-202ENST00000445545 FBLN2P98095 1184 aa23.84■■□□□ 1.41
CROCC-202ENST00000445545 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CROCC-202ENST00000445545 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.72■■□□□ 1.39
CROCC-202ENST00000445545 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CROCC-202ENST00000445545 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CROCC-202ENST00000445545 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CROCC-202ENST00000445545 P3H3Q8IVL6 736 aa23.64■■□□□ 1.37
CROCC-202ENST00000445545 WIZO95785 1651 aa23.59■■□□□ 1.37
CROCC-202ENST00000445545 ITGAEP38570 1179 aa23.59■■□□□ 1.37
CROCC-202ENST00000445545 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.58■■□□□ 1.37
CROCC-202ENST00000445545 ARID3CA6NKF2 412 aa23.56■■□□□ 1.36
CROCC-202ENST00000445545 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.44■■□□□ 1.34
CROCC-202ENST00000445545 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.43■■□□□ 1.34
CROCC-202ENST00000445545 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.35■■□□□ 1.33
CROCC-202ENST00000445545 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CROCC-202ENST00000445545 SMARCA4P51532 1647 aa23.28■■□□□ 1.32
CROCC-202ENST00000445545 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
CROCC-202ENST00000445545 ABCC8Q09428 1581 aa23.25■■□□□ 1.31
CROCC-202ENST00000445545 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CROCC-202ENST00000445545 SMARCA2P51531 1590 aa23.17■■□□□ 1.3
CROCC-202ENST00000445545 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.16■■□□□ 1.3
CROCC-202ENST00000445545 ERCC6Q03468 1493 aa23.13■■□□□ 1.29
CROCC-202ENST00000445545 SOGA1O94964 1423 aa23.12■■□□□ 1.29
CROCC-202ENST00000445545 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CROCC-202ENST00000445545 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.09■■□□□ 1.29
CROCC-202ENST00000445545 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CROCC-202ENST00000445545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CROCC-202ENST00000445545 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CROCC-202ENST00000445545 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.99■■□□□ 1.27
CROCC-202ENST00000445545 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CROCC-202ENST00000445545 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.92■■□□□ 1.26
CROCC-202ENST00000445545 NESP48681 1621 aa22.87■■□□□ 1.25
CROCC-202ENST00000445545 CUX2O14529 1486 aa22.86■■□□□ 1.25
CROCC-202ENST00000445545 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.85■■□□□ 1.25
CROCC-202ENST00000445545 NCAPD3P42695 1498 aa22.83■■□□□ 1.25
CROCC-202ENST00000445545 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.83■■□□□ 1.24
CROCC-202ENST00000445545 KIF27Q86VH2 1401 aa22.81■■□□□ 1.24
CROCC-202ENST00000445545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CROCC-202ENST00000445545 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
CROCC-202ENST00000445545 CLIP1P30622 1438 aa22.73■■□□□ 1.23
CROCC-202ENST00000445545 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.72■■□□□ 1.23
CROCC-202ENST00000445545 CEP162Q5TB80 1403 aa22.68■■□□□ 1.22
CROCC-202ENST00000445545 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.67■■□□□ 1.22
CROCC-202ENST00000445545 GOLGA3Q08378 1498 aa22.61■■□□□ 1.21
CROCC-202ENST00000445545 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
CROCC-202ENST00000445545 TRIM52Q96A61 297 aa22.6■■□□□ 1.21
CROCC-202ENST00000445545 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.59■■□□□ 1.21
CROCC-202ENST00000445545 KCNH8Q96L42 1107 aa22.58■■□□□ 1.21
CROCC-202ENST00000445545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.56■■□□□ 1.2
CROCC-202ENST00000445545 NEUROD1Q13562 356 aa22.54■■□□□ 1.2
CROCC-202ENST00000445545 EEA1Q15075 1411 aa22.54■■□□□ 1.2
CROCC-202ENST00000445545 HRCP23327 699 aa22.53■■□□□ 1.2
CROCC-202ENST00000445545 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CROCC-202ENST00000445545 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.48■■□□□ 1.19
CROCC-202ENST00000445545 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.45■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.44■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 CFTRP13569 1480 aa22.44■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.42■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.4■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.4■■□□□ 1.18
CROCC-202ENST00000445545 HMGXB3Q12766 1538 aa22.35■■□□□ 1.17
CROCC-202ENST00000445545 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CROCC-202ENST00000445545 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.33■■□□□ 1.17
CROCC-202ENST00000445545 SYNJ1O43426 1573 aa22.33■■□□□ 1.17
CROCC-202ENST00000445545 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CROCC-202ENST00000445545 IGF1RP08069 1367 aa22.3■■□□□ 1.16
CROCC-202ENST00000445545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.26■■□□□ 1.15
CROCC-202ENST00000445545 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.24■■□□□ 1.15
CROCC-202ENST00000445545 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CROCC-202ENST00000445545 JPH4Q96JJ6 628 aa22.22■■□□□ 1.15
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