Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDHA7Q9UN72 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms