Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DENND2AQ9ULE3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms