Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SCOCQ9UIL1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SCOCQ9UIL1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms