Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
HMG20BQ9P0W2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMG20BQ9P0W2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms