Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SMARCC1Q92922 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMARCC1Q92922 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms