Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RIPPLY1Q0D2K3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms