Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDE4CQ08493 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDE4CQ08493 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms