Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HOXC5Q00444 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HOXC5Q00444 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms