Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 PCID2-201ENST00000246505 1786 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.115e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HNRNPA1L2-201ENST00000357495 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.145e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DOCK2-214ENST00000523351 3777 ntTSL 57.8□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-207ENST00000447745 793 ntTSL 37.67□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MICU2-207ENST00000479790 1811 ntTSL 27.55□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-212ENST00000497358 700 ntTSL 37.45□□□□□ -1.225e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.235e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PNPT1-201ENST00000260604 3596 ntTSL 57.26□□□□□ -1.255e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DOCK2-209ENST00000520450 2774 ntTSL 27.02□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PRKAR2A-207ENST00000457914 448 ntTSL 36.86□□□□□ -1.315e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PNPT1-202ENST00000415374 3308 ntTSL 56.83□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NDUFB3-201ENST00000237889 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.324e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NUB1-211ENST00000497987 861 ntTSL 26.81□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.325e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.345e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-203ENST00000546588 1059 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-208ENST00000508381 2520 ntTSL 26.25□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.425e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-209ENST00000463102 599 ntTSL 26.12□□□□□ -1.435e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-203ENST00000440943 1660 ntTSL 55.66□□□□□ -1.55e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-210ENST00000485608 3149 ntTSL 25.54□□□□□ -1.525e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-205ENST00000503400 5239 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCNB1-203ENST00000505500 1190 ntTSL 1 (best)5.43□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.545e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NUB1-203ENST00000468404 1703 ntTSL 55.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.585e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.624e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.635e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-208ENST00000486978 609 ntTSL 34.8□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-215ENST00000493650 4202 ntTSL 24.78□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.654e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.665e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NUB1-205ENST00000470316 1752 ntTSL 54.6□□□□□ -1.675e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.684e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.695e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.725e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MAST2-205ENST00000470809 640 ntTSL 34.07□□□□□ -1.765e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RCHY1-204ENST00000505105 1304 ntTSL 1 (best)3.78□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.815e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PDIA5-203ENST00000469649 722 ntTSL 53.62□□□□□ -1.835e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.835e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCNB1-205ENST00000507798 767 ntTSL 33.59□□□□□ -1.835e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 ABCB10-203ENST00000498158 877 ntTSL 53.55□□□□□ -1.845e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-203ENST00000445419 3663 ntTSL 23.5□□□□□ -1.855e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MICU2-202ENST00000460488 748 ntTSL 33.42□□□□□ -1.865e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RCHY1-207ENST00000512567 1164 ntTSL 1 (best)3.14□□□□□ -1.915e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.935e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 NUB1-208ENST00000480907 977 ntTSL 52.94□□□□□ -1.945e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-205ENST00000548539 598 ntTSL 32.8□□□□□ -1.965e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 IBTK-207ENST00000505222 5547 ntTSL 1 (best)2.71□□□□□ -1.975e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-203ENST00000416688 368 ntTSL 32.63□□□□□ -1.995e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DROSHA-221ENST00000514927 567 ntTSL 22.15□□□□□ -2.074e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCNB1-207ENST00000513102 463 ntTSL 21.66□□□□□ -2.145e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.27e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.57e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HDAC2-215ENST00000523334 4810 ntTSL 23.24□□□□□ -1.897e-11■■■■■ 28.3
SUB1P53999 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.538e-24■■■■■ 28.2
SUB1P53999 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.438e-24■■■■■ 28.2
SUB1P53999 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.148e-24■■■■■ 28.2
SUB1P53999 HNRNPD-211ENST00000514671 1089 ntTSL 57.08□□□□□ -1.288e-24■■■■■ 28.2
SUB1P53999 HNRNPD-210ENST00000514325 4597 ntTSL 1 (best)3.49□□□□□ -1.858e-24■■■■■ 28.2
SUB1P53999 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.684e-8■■■■■ 28.2
SUB1P53999 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.784e-8■■■■■ 28.2
SUB1P53999 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 28.2
SUB1P53999 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 28.2
SUB1P53999 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 28.2
SUB1P53999 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-7■■■■■ 28.2
SUB1P53999 CCT2-214ENST00000553169 758 ntTSL 25.66□□□□□ -1.56e-11■■■■■ 28.1
SUB1P53999 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.027e-7■■■■■ 28.1
SUB1P53999 RPL22-201ENST00000234875 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-11■■■■■ 28.1
SUB1P53999 RPL22-207ENST00000484532 449 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.273e-11■■■■■ 28.1
SUB1P53999 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.065e-17■■■■■ 28.1
SUB1P53999 EIF3M-212ENST00000532444 633 ntTSL 511.96□□□□□ -0.499e-9■■■■■ 28.1
SUB1P53999 EIF3M-207ENST00000530026 769 ntTSL 23.52□□□□□ -1.859e-9■■■■■ 28.1
SUB1P53999 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 510.48□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 28
SUB1P53999 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 28
SUB1P53999 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 28
SUB1P53999 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-8■■■■■ 28
SUB1P53999 STOML2-204ENST00000488050 904 ntTSL 57.86□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 28
SUB1P53999 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.886e-15■■■■■ 28
SUB1P53999 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.896e-15■■■■■ 28
SUB1P53999 ASNS-216ENST00000487714 689 ntTSL 24.48□□□□□ -1.692e-22■■■■■ 27.9
SUB1P53999 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.752e-9■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NAP1L1-224ENST00000552056 1981 ntTSL 52.62□□□□□ -1.992e-7■■■■■ 27.9
SUB1P53999 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 27.9
SUB1P53999 EIF3M-210ENST00000531921 1697 ntTSL 213.89□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 27.9
SUB1P53999 EIF3M-201ENST00000323213 889 ntTSL 511.63□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 313.33□□□□□ -0.284e-18■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NDUFC1-202ENST00000394225 664 ntTSL 211.78□□□□□ -0.524e-18■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-18■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.574e-18■■■■■ 27.9
SUB1P53999 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.684e-18■■■■■ 27.9
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