Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRE11P49959 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRE11P49959 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRE11P49959 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRE11P49959 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRE11P49959 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MRE11P49959 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRE11P49959 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRE11P49959 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRE11P49959 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms