Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AMTP48728 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AMTP48728 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMTP48728 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMTP48728 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMTP48728 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMTP48728 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms