Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GTF2E2P29084 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2E2P29084 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms