Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms