Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAF8Q9UPN6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAF8Q9UPN6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAF8Q9UPN6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms