Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GSKIPQ9P0R6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GSKIPQ9P0R6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms