Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.772e-20■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-206ENST00000466368 548 ntTSL 423.82■■□□□ 1.42e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.976e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.663e-34■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPG7-205ENST00000561945 411 ntTSL 322.98■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 521.21■□□□□ 0.996e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-204ENST00000474945 981 ntTSL 220.86■□□□□ 0.936e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-206ENST00000619898 4254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.186e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-205ENST00000602728 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-203ENST00000448693 826 ntTSL 215.4■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 SPCS1-202ENST00000423431 822 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.056e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.051e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 340.6■■■■■ 4.096e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 337.25■■■■□ 3.556e-7■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.352e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.252e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 PCMTD2-203ENST00000308824 3843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -02e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 PCMTD2-209ENST00000609818 551 ntTSL 410.34□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 330.18■■■□□ 2.422e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 530.18■■■□□ 2.422e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)27.74■■■□□ 2.032e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.71e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.361e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.879e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.799e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.69e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.549e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.249e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.219e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.949e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.499e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.199e-8■■■■□ 24.4
DROSHAQ9NRR4 CTDNEP1-206ENST00000571409 741 ntTSL 546.65■■■■■ 5.062e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.62e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.252e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.072e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.942e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 CTDNEP1-211ENST00000575783 876 ntTSL 526.49■■□□□ 1.832e-14■■■■□ 24.3
DROSHAQ9NRR4 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)31.71■■■□□ 2.676e-7■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.721e-7■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 EPS8L2-216ENST00000530118 561 ntTSL 325.67■■□□□ 1.71e-7■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 HNRNPH1-249ENST00000524180 997 ntTSL 521.73■■□□□ 1.073e-32■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MLF2-204ENST00000536249 570 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.43e-6■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-202ENST00000546632 607 ntTSL 233.5■■■□□ 2.955e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 JAG2-203ENST00000546616 2275 ntTSL 530.24■■■□□ 2.435e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 229.12■■■□□ 2.255e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.025e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-213ENST00000552255 509 ntTSL 425.38■■□□□ 1.655e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-209ENST00000549231 538 ntTSL 423.06■■□□□ 1.285e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)22.95■■□□□ 1.265e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 322.59■■□□□ 1.215e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-204ENST00000427777 521 ntTSL 421.89■■□□□ 1.15e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 321.06■□□□□ 0.965e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-211ENST00000477714 756 ntTSL 220.97■□□□□ 0.955e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-211ENST00000551351 532 ntTSL 420.55■□□□□ 0.885e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.595e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-203ENST00000546805 596 ntTSL 518.48■□□□□ 0.555e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 MBD6-208ENST00000549042 533 ntTSL 417.18■□□□□ 0.345e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-203ENST00000424557 549 ntTSL 411.41□□□□□ -0.585e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 CTC1-201ENST00000315684 7021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 FAM118A-206ENST00000452238 583 ntTSL 59.66□□□□□ -0.865e-8■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.198e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 317.36■□□□□ 0.378e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 215.84■□□□□ 0.138e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-202ENST00000524422 720 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.248e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-208ENST00000534385 623 ntTSL 212.18□□□□□ -0.468e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 210.16□□□□□ -0.788e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 29.06□□□□□ -0.968e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-206ENST00000424110 546 ntTSL 421.69■■□□□ 1.064e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-204ENST00000403432 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.254e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-210ENST00000442400 955 ntTSL 512.79□□□□□ -0.364e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-207ENST00000429419 547 ntTSL 59.62□□□□□ -0.874e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 57.06□□□□□ -1.284e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 PUM2-208ENST00000432105 584 ntTSL 56.38□□□□□ -1.394e-9■■■■□ 24.2
DROSHAQ9NRR4 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 341.92■■■■■ 4.32e-6■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.923e-6■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.825e-9■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.35e-9■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 535.29■■■■□ 3.245e-9■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CUL4A-208ENST00000474116 866 ntTSL 228.02■■■□□ 2.085e-9■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.431e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.681e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 ZRANB2-206ENST00000487510 579 ntTSL 21.64□□□□□ -2.151e-10■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.81e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-215ENST00000557123 569 ntTSL 327.95■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-213ENST00000556757 588 ntTSL 227.95■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-210ENST00000555132 554 ntTSL 427.95■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-208ENST00000553995 583 ntTSL 227.95■■■□□ 2.061e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-207ENST00000553964 2670 ntTSL 1 (best)27.46■■□□□ 1.991e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-206ENST00000553630 1420 ntTSL 527.4■■□□□ 1.981e-7■■■■□ 24.1
DROSHAQ9NRR4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.421e-7■■■■□ 24.1
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