RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423431.5

SPCS1-202, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SPCS1, Length 822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-202ENST00000423431 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
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SPCS1-202ENST00000423431 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SPCS1-202ENST00000423431 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SPCS1-202ENST00000423431 FOXD1Q16676 465 aa24.4■■□□□ 1.5
SPCS1-202ENST00000423431 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.2■■□□□ 1.3
SPCS1-202ENST00000423431 MSH5O43196 834 aa22.81■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.8■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SPCS1-202ENST00000423431 ADRA2BP18089 450 aa22.72■■□□□ 1.23
SPCS1-202ENST00000423431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.64■■□□□ 1.21
SPCS1-202ENST00000423431 POTEDQ86YR6 584 aa22.38■■□□□ 1.17
SPCS1-202ENST00000423431 ABCC9O60706 1549 aa21.6■■□□□ 1.05
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SPCS1-202ENST00000423431 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
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SPCS1-202ENST00000423431 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SPCS1-202ENST00000423431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.57■□□□□ 0.88
SPCS1-202ENST00000423431 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.35■□□□□ 0.85
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SPCS1-202ENST00000423431 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.83■□□□□ 0.77
SPCS1-202ENST00000423431 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
SPCS1-202ENST00000423431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.78■□□□□ 0.76
SPCS1-202ENST00000423431 NACADO15069 1562 aa19.7■□□□□ 0.74
SPCS1-202ENST00000423431 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
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SPCS1-202ENST00000423431 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.5■□□□□ 0.71
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SPCS1-202ENST00000423431 RNF39Q9H2S5 420 aa19.48■□□□□ 0.71
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SPCS1-202ENST00000423431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa19.06■□□□□ 0.64
SPCS1-202ENST00000423431 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
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SPCS1-202ENST00000423431 SCRIBQ14160 1630 aa18.87■□□□□ 0.61
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SPCS1-202ENST00000423431 ERCC6Q03468 1493 aa18.72■□□□□ 0.59
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SPCS1-202ENST00000423431 SLC4A2P04920 1241 aa18.43■□□□□ 0.54
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SPCS1-202ENST00000423431 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.93■□□□□ 0.46
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SPCS1-202ENST00000423431 SMARCA4P51532 1647 aa17.83■□□□□ 0.44
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SPCS1-202ENST00000423431 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa17.73■□□□□ 0.43
SPCS1-202ENST00000423431 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.69■□□□□ 0.42
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SPCS1-202ENST00000423431 ZBTB22O15209 634 aa17.35■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SPCS1-202ENST00000423431 FBLN2P98095 1184 aa17.3■□□□□ 0.36
SPCS1-202ENST00000423431 CFTRP13569 1480 aa17.26■□□□□ 0.35
SPCS1-202ENST00000423431 IFT140Q96RY7 1462 aa17.25■□□□□ 0.35
SPCS1-202ENST00000423431 WIZO95785 1651 aa17.23■□□□□ 0.35
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