Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PACS2Q86VP3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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