Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAX1Q5SQQ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAX1Q5SQQ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms