Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
USF2Q15853 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
USF2Q15853 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms