Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.379e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-211ENST00000481132 7690 ntTSL 26.48□□□□□ -1.379e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 56.37□□□□□ -1.399e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-212ENST00000481389 599 ntTSL 56.09□□□□□ -1.439e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OAT-207ENST00000492376 620 ntTSL 35.97□□□□□ -1.459e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.469e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 USP48-202ENST00000374730 570 ntTSL 45.76□□□□□ -1.499e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 XRCC5-207ENST00000471649 610 ntTSL 25.74□□□□□ -1.499e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-208ENST00000435414 687 ntTSL 55.65□□□□□ -1.59e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SEPT7-217ENST00000635175 1464 ntTSL 25.64□□□□□ -1.519e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-222ENST00000492144 993 ntTSL 25.46□□□□□ -1.544e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-213ENST00000465792 734 ntTSL 25.43□□□□□ -1.544e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EAPP-202ENST00000554792 774 ntTSL 25.29□□□□□ -1.569e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 55.29□□□□□ -1.569e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 LRPPRC-206ENST00000463456 3549 ntTSL 24.87□□□□□ -1.639e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.649e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 NDFIP1-202ENST00000503388 4164 ntTSL 24.49□□□□□ -1.699e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4A2-214ENST00000466362 545 ntTSL 24.41□□□□□ -1.74e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 OAT-204ENST00000476917 646 ntTSL 34.33□□□□□ -1.729e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SSFA2-210ENST00000470129 269 ntTSL 34.31□□□□□ -1.724e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MED4-204ENST00000495013 460 ntTSL 34.15□□□□□ -1.759e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.759e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.779e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ALYREF-201ENST00000504015 254 ntTSL 33.69□□□□□ -1.824e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 CLK2-204ENST00000471047 701 ntTSL 310.18□□□□□ -0.781e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 MRPS5-202ENST00000345084 1359 ntTSL 211.93□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF4G1-235ENST00000482303 493 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 BCCIP-201ENST00000278100 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.744e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.294e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.254e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.184e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-203ENST00000517329 645 ntTSL 215.7■□□□□ 0.14e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.044e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-206ENST00000519339 1815 ntTSL 1 (best)14.48□□□□□ -0.094e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.154e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.474e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.54e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-210ENST00000521423 926 ntTSL 510.92□□□□□ -0.664e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-215ENST00000522574 1394 ntTSL 29.21□□□□□ -0.944e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TNIP1-204ENST00000517504 562 ntTSL 57.68□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 55.48□□□□□ -1.537e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF3B-212ENST00000494658 637 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 214.18□□□□□ -0.141e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 213.75□□□□□ -0.211e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 29.87□□□□□ -0.831e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 C19orf53-205ENST00000592760 357 ntTSL 36.08□□□□□ -1.443e-7■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.883e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.833e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRSF11-211ENST00000473950 796 ntTSL 524.67■■□□□ 1.544e-6■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 224.41■■□□□ 1.53e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.243e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.13e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.763e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PIEZO1-203ENST00000419505 1635 ntTSL 1 (best)19.5■□□□□ 0.711e-14■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.71e-14■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 DDX54-207ENST00000550016 594 ntTSL 519.32■□□□□ 0.683e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.63e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 GIGYF1-204ENST00000472105 500 ntTSL 318.53■□□□□ 0.563e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ADGRL1-204ENST00000589616 675 ntTSL 517.25■□□□□ 0.353e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 PIEZO1-208ENST00000484567 2464 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-14■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 DDX54-204ENST00000546898 479 ntTSL 316.35■□□□□ 0.213e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.183e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-21■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.083e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRP68-210ENST00000591272 507 ntTSL 314.77□□□□□ -0.053e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 TOP3B-215ENST00000470338 624 ntTSL 514.49□□□□□ -0.093e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRSF6-202ENST00000483871 1680 ntTSL 213.49□□□□□ -0.253e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.953e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.013e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.391e-9■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 RABL6-207ENST00000461992 763 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.328e-8■■□□□ 13.5
PUM1Q14671 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.951e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 MYH10-209ENST00000476737 592 ntTSL 512.12□□□□□ -0.476e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 PFDN4-205ENST00000493356 659 ntTSL 323.73■■□□□ 1.392e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 PFDN4-204ENST00000487129 762 ntTSL 216.84■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 PFDN4-202ENST00000441080 579 ntTSL 56□□□□□ -1.452e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.854e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 MCM3-207ENST00000616552 3208 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.964e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 MCM3-205ENST00000596288 3169 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.054e-7■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.522e-6■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 POLE3-204ENST00000479871 2396 ntTSL 213.65□□□□□ -0.226e-10■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 POLE3-202ENST00000374171 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.616e-10■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 POLE3-201ENST00000374169 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.716e-10■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 CNOT3-203ENST00000440571 1125 ntTSL 522.58■■□□□ 1.212e-8■■□□□ 13.4
PUM1Q14671 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.455e-7■■□□□ 13.4
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 161.8 ms