Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDE4BQ07343 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE4BQ07343 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms