Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NKX2-5P52952 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKX2-5P52952 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms