Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMAN1P49257 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMAN1P49257 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms