Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CLIP1P30622 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms