Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
S100A1P23297 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
S100A1P23297 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
S100A1P23297 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
S100A1P23297 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
S100A1P23297 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
S100A1P23297 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
S100A1P23297 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S100A1P23297 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
S100A1P23297 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
S100A1P23297 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
S100A1P23297 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms