Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
SERP1Q9Y6X1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms