Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRAPPC2LQ9UL33 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms