Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MCM9Q9NXL9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM9Q9NXL9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM9Q9NXL9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms