Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.461e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.021e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.811e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-207ENST00000587089 880 ntTSL 525.16■■□□□ 1.621e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.621e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.41e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.271e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.241e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-216ENST00000593046 800 ntTSL 221.29■■□□□ 11e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-213ENST00000589226 604 ntTSL 221.01■□□□□ 0.951e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-210ENST00000588147 489 ntTSL 1 (best)20.62■□□□□ 0.891e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.881e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-215ENST00000592920 583 ntTSL 520.56■□□□□ 0.881e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 TNNT1-205ENST00000586282 327 ntTSL 56.93□□□□□ -1.31e-10■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.552e-7■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 EMC7-204ENST00000532113 607 ntTSL 534.15■■■■□ 3.063e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.813e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 EMC7-202ENST00000527822 581 ntTSL 226.84■■□□□ 1.893e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 EMC7-203ENST00000528949 506 ntTSL 31.78□□□□□ -2.123e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 331.3■■■□□ 2.62e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 236.09■■■■□ 3.375e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 235.84■■■■□ 3.335e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 532.04■■■□□ 2.725e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-209ENST00000575822 613 ntTSL 331.58■■■□□ 2.655e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.545e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 KCNN4-204ENST00000599107 687 ntTSL 230.21■■■□□ 2.435e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.376e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.365e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.276e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-206ENST00000455334 796 ntTSL 529.24■■■□□ 2.276e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.26e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-221ENST00000483778 1103 ntTSL 328.25■■■□□ 2.115e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-205ENST00000450548 724 ntTSL 328.23■■■□□ 2.116e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-204ENST00000591216 611 ntTSL 327.57■■■□□ 26e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)26.35■■□□□ 1.815e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.765e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 AC136475.3-201ENST00000533924 309 ntTSL 525.95■■□□□ 1.745e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.735e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 524.79■■□□□ 1.565e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 524.59■■□□□ 1.535e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 224.24■■□□□ 1.476e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.433e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-202ENST00000400771 663 ntTSL 523.91■■□□□ 1.425e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-209ENST00000425239 807 ntTSL 223.84■■□□□ 1.415e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-215ENST00000468018 721 ntTSL 523.45■■□□□ 1.345e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 223.25■■□□□ 1.313e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.286e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.273e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-223ENST00000493618 899 ntTSL 522.78■■□□□ 1.245e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.15e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.045e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.015e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.925e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.95e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.426e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.376e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-208ENST00000592561 771 ntTSL 216.75■□□□□ 0.276e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.276e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-212ENST00000430617 623 ntTSL 316.62■□□□□ 0.255e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 ATG4B-211ENST00000429899 524 ntTSL 416.62■□□□□ 0.255e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 RNASEK-208ENST00000570898 425 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.185e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 BANF1-207ENST00000530204 586 ntTSL 514.06□□□□□ -0.163e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PSMD8-206ENST00000592001 853 ntTSL 213.67□□□□□ -0.226e-13■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.275e-9■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 BANF1-204ENST00000524663 251 ntTSL 313.2□□□□□ -0.33e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.626e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 DCAF6-209ENST00000470919 827 ntTSL 22.98□□□□□ -1.936e-17■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)27.18■■□□□ 1.946e-7■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 MED16-205ENST00000586017 1403 ntTSL 1 (best)22.79■■□□□ 1.246e-7■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 MED16-211ENST00000606828 599 ntTSL 1 (best)20.94■□□□□ 0.946e-7■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.86□□□□□ -2.275e-6■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.968e-8■■■■□ 24.7
DROSHAQ9NRR4 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 414.42□□□□□ -0.12e-8■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 FTX-218ENST00000641360 3897 nt8.08□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 ACVR2B-203ENST00000465020 1666 ntTSL 227.34■■□□□ 1.976e-7■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-226ENST00000490583 888 ntTSL 326.46■■□□□ 1.832e-7■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-204ENST00000416427 645 ntTSL 538.99■■■■□ 3.834e-9■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-206ENST00000421656 333 ntTSL 326.21■■□□□ 1.794e-9■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 223.6■■□□□ 1.374e-9■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-209ENST00000432879 744 ntTSL 321.93■■□□□ 1.14e-9■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 24.43□□□□□ -1.74e-9■■■■□ 24.6
DROSHAQ9NRR4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.031e-6■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.841e-6■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.771e-6■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 HOXB7-203ENST00000567101 528 ntTSL 216.89■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.556e-14■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-209ENST00000479398 550 ntTSL 531.73■■■□□ 2.673e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 GALNS-206ENST00000564263 496 ntTSL 228.25■■■□□ 2.113e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.513e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 222.43■■□□□ 1.183e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)21.76■■□□□ 1.073e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 321.32■■□□□ 13e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-205ENST00000432667 2572 ntTSL 521.18■□□□□ 0.985e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 415.54■□□□□ 0.083e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 313.69□□□□□ -0.223e-7■■■■□ 24.5
DROSHAQ9NRR4 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 24.5
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