Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMIM3Q9BZL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms