Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM2D3Q9BRN9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms