Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWA1

TMEM40, Transmembrane protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM40Q8WWA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM40Q8WWA1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM40Q8WWA1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms