Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RIN1-203ENST00000526246 4416 ntTSL 211.63□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.578e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.68e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-202ENST00000612728 1981 ntTSL 1 (best)10.48□□□□□ -0.738e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 LRRC27-202ENST00000368612 1765 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.788e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 DNMT1-218ENST00000589294 575 ntTSL 210.04□□□□□ -0.88e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 STAG2-218ENST00000483575 864 ntTSL 58.99□□□□□ -0.974e-13■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-206ENST00000619446 819 ntTSL 38.96□□□□□ -0.988e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 LRRC27-206ENST00000462656 2302 ntTSL 28.7□□□□□ -1.028e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 FAM111B-204ENST00000529618 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.118e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 LRRC27-204ENST00000368614 6374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.158e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 LRRC27-207ENST00000472387 540 ntTSL 37.74□□□□□ -1.178e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.188e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 SAR1A-207ENST00000452767 672 ntTSL 56.84□□□□□ -1.318e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 STAG2-216ENST00000471107 709 ntTSL 55.79□□□□□ -1.484e-13■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.518e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.548e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-205ENST00000617922 4420 ntTSL 25.39□□□□□ -1.558e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CEP120-206ENST00000508442 2645 ntTSL 25.39□□□□□ -1.558e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 35.26□□□□□ -1.574e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.578e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 STAG2-214ENST00000466748 873 ntTSL 55.21□□□□□ -1.584e-13■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.598e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 PSMA6-210ENST00000555050 309 ntTSL 24.71□□□□□ -1.668e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CBX1-204ENST00000444685 544 ntTSL 54.68□□□□□ -1.668e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.678e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 SIN3A-213ENST00000570021 600 ntTSL 34.45□□□□□ -1.78e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-201ENST00000612494 494 ntTSL 34.43□□□□□ -1.78e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CXCL8-203ENST00000483500 599 ntTSL 24.33□□□□□ -1.728e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ZNHIT3-211ENST00000622013 505 ntTSL 34.3□□□□□ -1.728e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.798e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.828e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 ATP5L-203ENST00000527186 1582 ntTSL 23.56□□□□□ -1.848e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 KIAA0586-204ENST00000538571 4232 ntTSL 53.46□□□□□ -1.868e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA1-207ENST00000481451 8619 ntTSL 23.42□□□□□ -1.868e-9■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 CEP120-205ENST00000508138 4720 ntTSL 1 (best)3.28□□□□□ -1.888e-12■■■■■ 44.3
PRPF8Q6P2Q9 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.98e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 NMD3-209ENST00000478160 606 ntTSL 32.14□□□□□ -2.078e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 SGMS1-205ENST00000498514 397 ntTSL 30.66□□□□□ -2.38e-12■■■■■ 44.3
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PRPF8Q6P2Q9 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.947e-19■■■■■ 44.2
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PRPF8Q6P2Q9 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.557e-19■■■■■ 44.2
PRPF8Q6P2Q9 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.897e-19■■■■■ 44.2
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PRPF8Q6P2Q9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-13■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SFXN1-208ENST00000507823 2611 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-13■■■■■ 44.1
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PRPF8Q6P2Q9 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.318e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 26.32□□□□□ -1.48e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 25.71□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 23.3□□□□□ -1.888e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 23.3□□□□□ -1.888e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RPL32-207ENST00000452606 631 ntTSL 25.73□□□□□ -1.491e-10■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-16■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-205ENST00000519103 488 ntTSL 30.84□□□□□ -2.278e-16■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.488e-16■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RIF1-202ENST00000414861 2534 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.551e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-206ENST00000453532 829 ntTSL 516.48■□□□□ 0.233e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-204ENST00000439684 596 ntTSL 316.45■□□□□ 0.223e-8■■■■■ 44.1
PRPF8Q6P2Q9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-8■■■■■ 44.1
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