Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERCC6LQ2NKX8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERCC6LQ2NKX8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms