Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RRS1Q15050 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRS1Q15050 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRS1Q15050 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRS1Q15050 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRS1Q15050 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRS1Q15050 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRS1Q15050 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms