Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM27E3Q08E93 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM27E3Q08E93 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms