Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HBBP68871 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HBBP68871 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HBBP68871 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBBP68871 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBBP68871 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBBP68871 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HBBP68871 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HBBP68871 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HBBP68871 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms