Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NCS1P62166 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NCS1P62166 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NCS1P62166 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NCS1P62166 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NCS1P62166 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NCS1P62166 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms