Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD40LGP29965 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CD40LGP29965 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms