Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMIM6P0DI80 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM6P0DI80 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms