Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RPSAP08865 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RPSAP08865 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RPSAP08865 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPSAP08865 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPSAP08865 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RPSAP08865 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms