Protein–RNA interactions for Protein: O43166

SIPA1L1, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L1O43166 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1L1O43166 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1L1O43166 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms